医院要顺利推进绩效工资制度，必须要坚持五大原则：
一、透明
对于医院职工来说，绩效工资制度透明是他们所希望的。医院绩效工资制度透明主要表现两个方面：一是医院职工必须能够了解到自己每月的绩效工资额度是多少，绩效工资实际发放额度是如何计算出来的；二是医院职工必须能够了解到医院整个绩效工资制度体系，他们能够掌握其他同事的绩效考核结果。
二、坚持以患者为中心
设计医院绩效工资制度时，必须坚持以患者为中心。患者是医院的衣食父母，患者的需求得到满足了，医护人员的口袋自然会鼓起来。在制定科室、岗位的绩效考核指标时，不仅需要关注财务指标，更重要的是要关注费财务指标，引导医护人员不断提高医疗服务质量、服务效率。
三、促进职工职业成长
医院属于知识密集型的组织。医院人才队伍成长，医院职工职业成长，对医院长期发展是至关重要的。医院绩效工资制度必须要能够促进职工职业成长。职工的职称提升了，会对他的绩效工资有影响；职工外出进修了，他的绩效工资还有保障；职工无故不参与医院组织的培训或学习，他的绩效工资会被扣减；职工职业能力不一样，他们的绩效工资也会有差异。
四、可操作性
可操作性主要表现在两个方面：一是指医院绩效工资制度在设计时概念要清晰，表达方式简单易懂，数据来源易于采集，降低管理成本，提高医院管理的时效性；二是指医院绩效工资制度体系，可以有效解决医院、科室管理中遇到的诸多问题，科室管理人员可以借助绩效工资制度，对科室进行有效管理。
五、系统性
系统性主要表现在两个方面：一是在考核体系设计时，将局部评价与整体评价有机结合，并根据指标对实现评价目标的重要程度，对指标及其权重进行合理取舍，达到评价指标既能突出重点，又能保持相对的均衡统一，实现系统的最优化；二是医院绩效工资制度要与医院业务管理体系、质量管理体系、人员管理体系等做好紧密衔接。